Sabikui Bisco lấy bối cảnh ở Nhật Bản sau khi “Cơn gió bụi” đã ăn mòn mọi thứ. Mọi người sống trong nỗi sợ hãi về sự rỉ sét ăn mòn các thành phố và cuộc sống nói chung. Một cậu bé tên là Bisco Akaboshi đến từ bộ tộc Người bảo vệ Nấm bị khinh thường bắt đầu cuộc hành trình để lấy nấm “Ăn rỉ” – một loại thuốc thần kỳ có thể thanh tẩy tất cả rỉ sét – để cứu người thầy đang hấp hối của mình.
Trong cuộc hành trình của mình, Bisco gặp Miro Nekoyanagi, một bác sĩ trẻ đẹp trai ở Imihama, và họ cùng nhau tìm kiếm một biện pháp chửa trị cho người chị gái yêu quý của Miro đang ăn mòn gỉ sắt.